Имхо, в этой истории сейчас больше шума чем реальных прогнозов. Думаю, всё что касается замены X на Wayland пока писано вилами на воде -- Wayland на данный момент не поддерживает всё то, что чем занимается X, а когда будет поддерживать, ещё уйдёт время на стабилизацию и попадание в дистрибутивы. Тем не менее, если предположить возможность такой замены в ближайшем будущем:
* Во-первых, X может работать как клиент Wayland:
http://wayland.freedesktop.org/architecture.html, см. X as a Wayland Client. Т.е. разработчики Wayland всё-таки задумаются о совместимости.
* Во-вторых, вопрос как быть с тулкитами лучше решать разработчикам тулкитов. LCL работает над GTK и Qt и теоретически ей должно быть всё равно что под ними -- X или Wayland. Когда/если GTK/Qt станут использовать Wayland, LCL (теоретически) менять не потребуется.
* Что потребуется менять -- так это GUI фреймворки, работающие с X напрямую -- MSEgui, fpGUI. В MSE не заглядывал, а у fpGUI архитектура достаточно хороша чтобы при необходимости перейти на новый backend относительно быстро и беспроблемно.